4月30日起，丰巢快递柜实行会员制收费。消息公布后，引发多个小区抵制。5月9日，丰巢方面回应称，很多社区因场地问题已经不能再增加柜机投放数了，而为了更好地服务用户，必须不断提高快件领取速度。
丰巢称，自从上线会员功能以来，12小时内的取件比例提升了5个百分点，这意味着每天早上可以空出近百万个格口，而丰巢快递柜在全国已经超过18万个，哪怕周转率提升1%，也会极大地提高资源使用率。
丰巢方面强调，不会停止会员收费，将联合快递企业尽早取件。
据国内媒体报道，圆通快递回应将采取系列应对措施：要求业务员事先联系客户确认，针对客户要求送货上门的务必安排上门派送等。菜鸟驿站表示，将继续提供免费保管服务，不会诱导强制消费者付费。
报道称，圆通快递回应称，将采取一系列措施应对：1、要求业务员实现联系客户确认，与客户沟通同意投入丰巢快递柜的，做好短信、电话录音、等信息保存工作。
2、立即梳理排查短信模板，需包含“问候语、放入位置、取件码及丰巢收费规则”等字样;针对客户要求送货上门的务必安排上门派送。
3、针对投递丰巢快递柜的快件，进行实施监控，投柜后8-10小时客户还未取走的，要及时联系客户，提醒客户及时取走。
菜鸟驿站则表示，遍布全国社区的站点将继续为消费者免费保管服务，不会诱导、强制消费付费。
天眼查数据显示，深圳丰巢科技公司目前的股东主要是顺丰系公司，最终受益人是顺丰创始人王卫。
2018年6月、7月，申通快递、韵达福分、中通快递相继从丰巢科技退股，均不再持有丰巢科技的股权。
